Flynn se v předvolební kampani účastnil shromáždění proti Clintonové a vedl skandování davů "Lock her up!" ("Zavřít ji do vězení!")
V ohnivém projevu na celostátním sjezdu Republikánské strany zdůraznil Flynn, že Spojené státy musejí zahájit agresivní vojenské akce proti Islámskému státu a spolupracovat daleko těsněji s Moskvou.
Flynn pravidelně vystupuje ve vysílání ruské televize Russia Today a účastnil se i gala večera RT, kdy seděl dvě křesla od Vladimíra Putina. Flynn se vyjadřuje, že nevidí rozdílu mezi televizí RT a americkými televizemi, jako je CNN.
Flynn odmítá "politickou korektnost" a ostře vystupuje proti muslimům jako celku.
V únoru napsal na Twitteru, že "strach z muslimů je racionální"
chudáci slniečkári..., nechcel by som byť v ich koži...