Predsedom Najvyššieho súdu sa Štefan Harabin stal v roku 1998, ešte na sklonku Mečiarovej éry. Vždy mal pritom blízko k HZDS, strane spätej s Ivanom Lexom, únosom Michala Kováča mladšieho, výbuchom auta s Robertom Remiášom a následnými amnestiami. Až tak, že sa stal jej nominantom na post ministra spravodlivosti.


