V januári 2017 ju strana MOST – HÍD navrhla do funkcie verejnej ochrankyne práv. Výhodou je, že nebola členkou žiadnej politickej strany a ani sa politicky neangažovala.[2] 8. februára získala v tajnom hlasovaní podporu 75 poslancov (zo 140). Kandidátka SaS a OĽaNO Janka Šípošová získala 41 hlasov, kandidát kotlebovcov Anton Čulen 15 hlasov. Po zvolení Patakyová uviedla, že by v poste chcela byť „priateľom ľudí“ a vykonávať ho nezaujato a nestranne.[3] Jej vzorom je bývalý český ombudsman Otakar Motejl.[3]
Do úradu bola menovaná 29. marca 2017 kedy na Bratislavskom hrade prevzala menovací dekrét od predsedu parlamentu Andreja Danka.[1] Mandát ombudsmanke vypršal 29. marca 2022 bez zvolenia ďalšieho nástupcu
