Židia však neboli schopní zaplatiť aj druhú časť – ďalších 25 000 dolárov a tak deportácie ďalej pokračovali. Dodnes však nie je jasné, či bol príčinou prestávky v transportoch skutočne Wislicenyho zásah. Do októbra 1942 bolo zo Slovenska vyvezených 57 752 Židov. Ďalšie transporty zatiaľ neboli možné, pretože väčšinu Židov, ktorí zostávali na Slovensku, chránili rôzne výnimky zo zákona. Podľa neskorších výpovedí na súde v Norimbergu sa Wisliceny dozvedel o likvidácii Židov, ktorá prebieha v Poľsku až na jeseň 1942, kedy mu to prezradil Eichmann. Bolo to práve v súvislosti so Slovenskými Židmi, ktorých životné podmienky v táboroch mala na vyžiadanie Slovenskej vlády ísť preveriť vládna komisia. Ani to však neznamenalo, že by vo svojej činnosti nejak poľavil. Po tom čo sa ukázalo, že prestávka v transportoch slovenských Židov potrvá dlhšie, dostal v januári 1943 v Berlíne rozkaz odísť do Grécka, kde mal riadiť činnosť proti tamojším Židom.