Najväčšími peripetiami prešiel projekt počas druhej vlády Mikuláša Dzurindu, keď sa na návrh Ivana Mikloša mala nedokončená budova SND predať americkej firme Truthheim Invest LLC, ktorá chcela budovu používať na komerčné účely a divadelníkom ju iba prenajímať.
Novovzniknuté občianske združenie Hlas pre kultúru sa postavilo proti akýmkoľvek formám predaja a žiadalo, aby sa nová budova SND dofinancovala z verejných zdrojov a jej jediným majiteľom bol štát. Stavbu dvoch politických systémov a dvoch storočí napokon dokončila až vláda Roberta Fica na jar roku 2007.