Rozhodovanie o agentúrach bolo rozhodovanie všetkých členských štátov EÚ. Každý z nich mal rovnaký počet hlasov.
Za to, že sa agentúra nedostala do nových členských štátov, môžu nové členské štáty. Namiesto toho, aby sa spojili pri hlasovaní a podporili najlepšieho z nich, v prípade EMA Bratislavu, hlasovali tak, že sa Bratislava nedostala do prvej trojice, kde by sme mali dosť dobrú šancu postúpiť do tretieho kola hlasovania.
Tak isto nové členské štáty nepodporili Prahu v prípade EBA.
Nové členské štáty podporovali svoje záujmy a hlasovanie do prvého kola ukázalo, že nové členské štáty sa nepostavili za Bratislavu, ani za Prahu či Waršavu, ale niektoré, hoci vedeli že nemajú šancu so svojou ponukou, presadzovali svoju ponuku prípadne, ako to potvrdila ministerka zdravotníctva Talianska, podporili ich ponuku.
Ak by nové členské štáty boli schopné sa dohodnúť na jednom kandidátovi spomedzi seba, tak minimálne jednu agentúru by dostali. Mali iné záujmy.